| 項目名稱 | 大學名稱 | 大學所在地 |
| 一、面向科學前沿類的2011計劃協(xié)同創(chuàng)新中心及牽頭高校名單 | ||
| 地球空間信息科學協(xié)同創(chuàng)新中心 | 武漢大學 | 湖北省 |
| 量子信息與量子科技前沿協(xié)同創(chuàng)新中心 | 中國科學技術大學 | 安徽省 |
| 量子物質科學協(xié)同創(chuàng)新中心 | 北京大學 | 北京市 |
| 人工微結構與量子調控協(xié)同創(chuàng)新中心 | 南京大學 | 江蘇省 |
| 天津化學化工協(xié)同創(chuàng)新中心 | 天津大學 | 天津市 |
| 玉米水稻小麥生物學協(xié)同創(chuàng)新中心 | 中國農業(yè)大學 | 北京市 |
| 生物治療協(xié)同創(chuàng)新中心 | 四川大學 | 四川省 |
| 大陸構造協(xié)同創(chuàng)新中心 | 西北大學 | 陜西省 |
| 二、面向文化傳承創(chuàng)新類的2011計劃協(xié)同創(chuàng)新中心及牽頭高校名單 | ||
| 社會轉型與社會管理協(xié)同創(chuàng)新中心 | 中國人民大學 | 北京市 |
| 中國特色社會主義經濟協(xié)同創(chuàng)新中心 | 南開大學 | 天津市 |
| 司法文明協(xié)同創(chuàng)新中心 | 中國政法大學 | 北京市 |
| 中國文化“走出去”協(xié)同創(chuàng)新中心 | 北京外國語大學 | 北京市 |
| 國家領土主權與海洋權益協(xié)同創(chuàng)新中心 | 武漢大學 | 湖北省 |
| 中國南海研究協(xié)同創(chuàng)新中心 | 南京大學 | 江蘇省 |
| 三、面向行業(yè)產業(yè)類的2011計劃協(xié)同創(chuàng)新中心及牽頭高校名單 | ||
| 有色金屬先進結構材料與制造協(xié)同創(chuàng)新中心 | 中南大學 | 湖南省 |
| 鋼鐵共性技術協(xié)同創(chuàng)新中心 | 北京科技大學 | 北京市 |
| 宇航科學與技術協(xié)同創(chuàng)新中心 | 哈爾濱工業(yè)大學 | 黑龍江省 |
| 先進航空發(fā)動機協(xié)同創(chuàng)新中心 | 北京航空航天大學 | 北京市 |
| 未來飛行器設計與制造共性基礎技術協(xié)同創(chuàng)新中心 | 西北工業(yè)大學 | 陜西省 |
| 智能型新能源汽車協(xié)同創(chuàng)新中心 | 同濟大學 | 上海市 |
| 軌道交通安全協(xié)同創(chuàng)新中心 | 北京交通大學 | 北京市 |
| 高端制造裝備協(xié)同創(chuàng)新中心 | 西安交通大學 | 陜西省 |
| 煤炭資源化利用發(fā)電技術協(xié)同創(chuàng)新中心 | 浙江大學 | 浙江省 |
| 食品安全與營養(yǎng)協(xié)同創(chuàng)新中心 | 江南大學 | 江蘇省 |
| 未來媒體網絡協(xié)同創(chuàng)新中心 | 上海交通大學 | 上海市 |
| 四、面向區(qū)域發(fā)展類的2011計劃協(xié)同創(chuàng)新中心及牽頭高校名單 | ||
| 納米科技協(xié)同創(chuàng)新中心 | 蘇州大學 | 江蘇省 |
| 先進生物與化學制造協(xié)同創(chuàng)新中心 | 南京工業(yè)大學 | 江蘇省 |
| 廣東高端制造裝備協(xié)同創(chuàng)新中心 | 華南理工大學 | 廣東省 |
| 煤的新型高效氣化與規(guī)模利用協(xié)同創(chuàng)新中心 | 西安交通大學 | 陜西省 |
| 腦重大疾病防治協(xié)同創(chuàng)新中心 | 首都醫(yī)科大學 | 北京市 |
| 高端醫(yī)療影像裝備及應用協(xié)同創(chuàng)新中心 | 東北大學 | 遼寧省 |
| 綠色制藥協(xié)同創(chuàng)新中心 | 浙江工業(yè)大學 | 浙江省 |
| 中原經濟區(qū)小麥玉米兩熟高產高效協(xié)同創(chuàng)新中心 | 河南農業(yè)大學 | 河南省 |
| 南方稻田作物多熟制現(xiàn)代化生產協(xié)同創(chuàng)新中心 | 湖南農業(yè)大學 | 湖南省 |
| 生物多樣性與云南特色農業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心 | 云南農業(yè)大學 | 云南省 |