1976年5月，參加工作。
1978年，考入南通醫(yī)學(xué)院（現(xiàn)南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院）醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)，
1983年，從南通醫(yī)學(xué)院畢業(yè)，獲得學(xué)士學(xué)位。
1987年2月，加入中國共產(chǎn)黨。
1988年，從南京鐵道醫(yī)學(xué)院（現(xiàn)東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院）畢業(yè)，獲得碩士學(xué)位，
1995年，從上海醫(yī)科大學(xué)（現(xiàn)復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院）畢業(yè)，獲得醫(yī)學(xué)博士學(xué)位。
1997年，首批入選“上海市衛(wèi)生系統(tǒng)百名跨世紀(jì)優(yōu)秀學(xué)科帶頭人培養(yǎng)計(jì)劃”。
1999年至2000年，以高級(jí)訪問學(xué)者身份赴美國匹茲堡大學(xué)移植中心從事肝移植及肝臟外科臨床研究。
2005年，入選“上海市醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才培養(yǎng)計(jì)劃”及“上海市百名領(lǐng)軍人才培養(yǎng)計(jì)劃”。
2013年12月，擔(dān)任復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院院長、肝外科主任、復(fù)旦大學(xué)器官移植中心副主任、復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系副主任、上海市肝腫瘤臨床醫(yī)學(xué)中心副主任。
2019年2月16日，在復(fù)旦中山廈門醫(yī)院成立樊嘉院士名醫(yī)工作室。
2016年10月，獲得何梁何利基金科學(xué)與技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)。
2016年11月，獲得第九屆談家楨生命科學(xué)臨床醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。
2017年11月，當(dāng)選中國科學(xué)院院士，隸屬于生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)學(xué)部。
復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院院長
復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院腫瘤防治中心主任
復(fù)旦大學(xué)肝癌研究所常務(wù)副所長
復(fù)旦大學(xué)器官移植中心主任
上海市肝腫瘤臨床醫(yī)學(xué)中心主任
上海市肝病研究所所長
中國醫(yī)師協(xié)會(huì)外科醫(yī)師分會(huì)肝臟外科醫(yī)師委員會(huì)主任委員
中國抗癌協(xié)會(huì)肝癌專業(yè)委員會(huì)前任主任委員
中國臨床腫瘤學(xué)會(huì)肝癌專家委員會(huì)副主任委員
第三屆中國抗癌協(xié)會(huì)醫(yī)院管理分會(huì)副主任委員
上海市醫(yī)學(xué)會(huì)外科?？品謺?huì)主任委員
上海市醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤分會(huì)副主任委員
上海市抗癌協(xié)會(huì)副理事
上海市醫(yī)學(xué)會(huì)器官移植分會(huì)委員
中華醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤分會(huì)常委
中華醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤學(xué)分會(huì)主任委員
中華醫(yī)學(xué)會(huì)常務(wù)理事
中華外科學(xué)會(huì)肝臟學(xué)組委員
中國抗癌協(xié)會(huì)肝癌專業(yè)委員會(huì)副主任委員
中國抗癌協(xié)會(huì)常務(wù)理事
上海市抗癌協(xié)會(huì)副理事長
上海市醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤分會(huì)副主任委員
上海市醫(yī)學(xué)會(huì)器官移植分會(huì)委員
美國臨床腫瘤學(xué)會(huì)（ASCO）會(huì)員
美國臨床外科學(xué)會(huì)（SSO）會(huì)員及國際肝膽胰協(xié)會(huì)委員
《中華外科雜志》、《中華肝膽外科雜志》、《中華實(shí)驗(yàn)外科雜志》《中華消化外科雜志》、《中國實(shí)用外科雜志》、《肝膽胰外科雜志》、《腹部外科雜志》、《外科理論與實(shí)踐雜志》、《肝膽外科雜志》、《消化外科雜志》、《中國臨床醫(yī)學(xué)雜志》等15本雜志副主編、編委
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